Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NPNTQ6UXI9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPNTQ6UXI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPNTQ6UXI9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPNTQ6UXI9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms