Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC8EQ6NSJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8EQ6NSJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC8EQ6NSJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms