Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RNF123Q5XPI4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RNF123Q5XPI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
RNF123Q5XPI4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RNF123Q5XPI4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.6 ms