Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CMPK2Q5EBM0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CMPK2Q5EBM0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CMPK2Q5EBM0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms