Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL39P5Q59GN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL39P5Q59GN2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms