Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX7

PLEKHG4, Puratrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4Q58EX7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PLEKHG4Q58EX7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLEKHG4Q58EX7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLEKHG4Q58EX7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLEKHG4Q58EX7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms