Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP20-1Q3LI63 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP20-1Q3LI63 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP20-1Q3LI63 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms