Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTC1Q2NKJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTC1Q2NKJ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTC1Q2NKJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTC1Q2NKJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms