Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF827Q17R98 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF827Q17R98 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF827Q17R98 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZNF827Q17R98 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZNF827Q17R98 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZNF827Q17R98 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms