Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UPP1Q16831 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPP1Q16831 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UPP1Q16831 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UPP1Q16831 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UPP1Q16831 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms