Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RTN1Q16799 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTN1Q16799 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTN1Q16799 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTN1Q16799 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTN1Q16799 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
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