Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STX1AQ16623 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX1AQ16623 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
STX1AQ16623 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX1AQ16623 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STX1AQ16623 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STX1AQ16623 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX1AQ16623 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STX1AQ16623 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STX1AQ16623 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX1AQ16623 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX1AQ16623 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX1AQ16623 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX1AQ16623 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX1AQ16623 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX1AQ16623 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STX1AQ16623 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STX1AQ16623 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STX1AQ16623 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STX1AQ16623 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX1AQ16623 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX1AQ16623 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX1AQ16623 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STX1AQ16623 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX1AQ16623 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX1AQ16623 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STX1AQ16623 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STX1AQ16623 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STX1AQ16623 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STX1AQ16623 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STX1AQ16623 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
STX1AQ16623 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX1AQ16623 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STX1AQ16623 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX1AQ16623 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms