Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HERC1Q15751 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HERC1Q15751 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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