Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR1Q15399 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR1Q15399 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TLR1Q15399 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TLR1Q15399 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
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