Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL9A2Q14055 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL9A2Q14055 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL9A2Q14055 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms