Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CIRBPQ14011 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CIRBPQ14011 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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