Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALCAMQ13740 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALCAMQ13740 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALCAMQ13740 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALCAMQ13740 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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