Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FHL3Q13643 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FHL3Q13643 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FHL3Q13643 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms