Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SF3B2Q13435 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SF3B2Q13435 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SF3B2Q13435 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
SF3B2Q13435 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SF3B2Q13435 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms