Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLF1Q13351 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLF1Q13351 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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