Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK3Q13003 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIK3Q13003 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIK3Q13003 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
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