Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 DRE2YKR071C 1047 nt7.64□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 YNL017CYNL017C 339 nt7.64□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 HEL1YKR017C 1656 nt7.63□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 PET117YER058W 324 nt7.63□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 RRP46YGR095C 672 nt7.63□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 CAR2YLR438W 1275 nt7.63□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 YOR041CYOR041C 432 nt7.63□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 ILV6YCL009C 930 nt7.63□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 FCP1YMR277W 2199 nt7.63□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 CCR4YAL021C 2514 nt7.62□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 YOS9YDR057W 1629 nt7.61□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.61□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 YBL112CYBL112C 318 nt7.61□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 YTH1YPR107C 627 nt7.61□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 POX1YGL205W 2247 nt7.61□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 CDC23YHR166C 1881 nt7.6□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 RPL2BYIL018W 765 nt7.6□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 MRPS18YNL306W 654 nt7.6□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 YNR005CYNR005C 405 nt7.6□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 RMD8YFR048W 1989 nt7.6□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 KDX1YKL161C 1302 nt7.59□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 SAL1YNL083W 1485 nt7.59□□□□□ -1.19
RTP1Q12751 CRH1YGR189C 1524 nt7.58□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 RGT2YDL138W 2292 nt7.58□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 TCB1YOR086C 3561 nt7.58□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 HGH1YGR187C 1185 nt7.58□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 GPA1YHR005C 1419 nt7.58□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 ASN2YGR124W 1719 nt7.58□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 PPS1YBR276C 2424 nt7.57□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 ASF1YJL115W 840 nt7.57□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 TAF9YMR236W 474 nt7.57□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 FLC2YAL053W 2352 nt7.57□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 BRN1YBL097W 2265 nt7.57□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 VPS65YLR322W 315 nt7.56□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 RCF2YNR018W 675 nt7.56□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 MSB3YNL293W 1902 nt7.55□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 GTS1YGL181W 1191 nt7.55□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 SNF7YLR025W 723 nt7.55□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 YMR252CYMR252C 405 nt7.55□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 ATP4YPL078C 735 nt7.55□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 ENB1YOL158C 1821 nt7.55□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 GDA1YEL042W 1557 nt7.54□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 FMO1YHR176W 1299 nt7.54□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 ERG24YNL280C 1317 nt7.53□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 BUD9YGR041W 1644 nt7.53□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 LSC1YOR142W 990 nt7.53□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 RFS1YBR052C 633 nt7.53□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 YAH1YPL252C 519 nt7.53□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 LEO1YOR123C 1395 nt7.53□□□□□ -1.2
RTP1Q12751 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.52□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.52□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 GCG1YER163C 699 nt7.52□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YIP4YGL198W 708 nt7.52□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YKL147CYKL147C 618 nt7.52□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YLR463CYLR463C 552 nt7.52□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 TFG2YGR005C 1203 nt7.51□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.5□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 PUS5YLR165C 765 nt7.5□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YOL099CYOL099C 492 nt7.5□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 CAN1YEL063C 1773 nt7.5□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 HNM1YGL077C 1692 nt7.5□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 NTG2YOL043C 1143 nt7.49□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 NUP49YGL172W 1419 nt7.49□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 RRP9YPR137W 1722 nt7.49□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 TPI1YDR050C 747 nt7.48□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 DMC1YER179W 1005 nt7.48□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 OSW2YLR054C 2175 nt7.48□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.48□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 YCR061WYCR061W 1896 nt7.47□□□□□ -1.21
RTP1Q12751 MED6YHR058C 888 nt7.46□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 RTC2YBR147W 891 nt7.46□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 MSS51YLR203C 1311 nt7.46□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 AFG3YER017C 2286 nt7.45□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 NSE5YML023C 1671 nt7.45□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 NUP84YDL116W 2181 nt7.45□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YNL092WYNL092W 1203 nt7.45□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 FSF1YOR271C 984 nt7.45□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YBR113WYBR113W 483 nt7.45□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YOR389WYOR389W 1875 nt7.45□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 CDC1YDR182W 1476 nt7.44□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 FZF1YGL254W 900 nt7.44□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YLL056CYLL056C 897 nt7.44□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 RNH201YNL072W 924 nt7.44□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 SRF1YDL133W 1314 nt7.44□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 GPD2YOL059W 1323 nt7.44□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 ELP3YPL086C 1674 nt7.44□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 FHN1YGR131W 525 nt7.43□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 OM45YIL136W 1182 nt7.43□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YML018CYML018C 1182 nt7.43□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YMR122CYMR122C 375 nt7.43□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 RPL43AYPR043W 279 nt7.43□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 ERG8YMR220W 1356 nt7.43□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 CHS5YLR330W 2016 nt7.42□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 NMD5YJR132W 3147 nt7.42□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 LOT6YLR011W 576 nt7.42□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 SPS22YCL048W 1392 nt7.42□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 SEC23YPR181C 2307 nt7.41□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 ICL2YPR006C 1728 nt7.41□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 YDR327WYDR327W 327 nt7.41□□□□□ -1.22
RTP1Q12751 HIS1YER055C 894 nt7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms