Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 ADE17YMR120C 1779 nt6.57□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.57□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 SPG5YMR191W 1122 nt6.57□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 VBA5YKR105C 1749 nt6.56□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 TUF1YOR187W 1314 nt6.56□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 BIM1YER016W 1035 nt6.56□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 YNR005CYNR005C 405 nt6.56□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 YLL058WYLL058W 1728 nt6.56□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 NAS6YGR232W 687 nt6.55□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 REC107YJR021C 945 nt6.55□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 RPR1RPR1 369 nt6.55□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 HSM3YBR272C 1443 nt6.55□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 MIP1YOR330C 3765 nt6.55□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 YBR241CYBR241C 1467 nt6.54□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 TOS2YGR221C 1869 nt6.54□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 YNR014WYNR014W 639 nt6.54□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 PRE5YMR314W 705 nt6.53□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 RGD2YFL047W 2145 nt6.53□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 NMD5YJR132W 3147 nt6.53□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 CIR2YOR356W 1896 nt6.53□□□□□ -1.36
SNF8Q12483 LAT1YNL071W 1449 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 MRPS28YDR337W 861 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YLR162WYLR162W 357 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 RPL31BYLR406C 342 nt6.52□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 RQC1YDR333C 2172 nt6.51□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 RPL2BYIL018W 765 nt6.51□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 URH1YDR400W 1023 nt6.5□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 PTC7YHR076W 1032 nt6.5□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YLL066CYLL066C 3618 nt6.5□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YOR389WYOR389W 1875 nt6.49□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YSC83YHR017W 1158 nt6.49□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 CBR1YIL043C 855 nt6.49□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YOX1YML027W 1158 nt6.49□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YPL247CYPL247C 1572 nt6.48□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 CDC13YDL220C 2775 nt6.48□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 PPH22YDL188C 1134 nt6.48□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 SML1YML058W 315 nt6.48□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YEN1YER041W 2280 nt6.48□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 PRI1YIR008C 1230 nt6.47□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 COX16YJL003W 357 nt6.47□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 ZIM17YNL310C 525 nt6.47□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 SGE1YPR198W 1632 nt6.47□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 MFG1YDL233W 1377 nt6.46□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YJL163CYJL163C 1668 nt6.46□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 SSC1YJR045C 1965 nt6.46□□□□□ -1.37
SNF8Q12483 YDL177CYDL177C 513 nt6.46□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.46□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 YGL102CYGL102C 429 nt6.46□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 FIT2YOR382W 462 nt6.46□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 EDC3YEL015W 1656 nt6.45□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 ICP55YER078C 1536 nt6.45□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 SMX3YPR182W 261 nt6.45□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 YMR034CYMR034C 1305 nt6.45□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 NUP49YGL172W 1419 nt6.44□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 AIM46YHR199C 933 nt6.44□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 MSC3YLR219W 2187 nt6.44□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 PEX31YGR004W 1389 nt6.44□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 MEU1YLR017W 1014 nt6.43□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 IRC11YOR013W 471 nt6.43□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 RPL5YPL131W 894 nt6.43□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 AGP2YBR132C 1791 nt6.42□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 OPI8YKR035C 642 nt6.42□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 YOL046CYOL046C 675 nt6.42□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 ERG10YPL028W 1197 nt6.42□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 SEC62YPL094C 825 nt6.42□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 OPI11YPR044C 354 nt6.42□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 HAL5YJL165C 2568 nt6.41□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 FCY22YER060W-A 1593 nt6.41□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 SMK1YPR054W 1167 nt6.41□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 YHR020WYHR020W 2067 nt6.41□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 VTS1YOR359W 1572 nt6.4□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 HIS1YER055C 894 nt6.4□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 DYS1YHR068W 1164 nt6.4□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 GCN3YKR026C 918 nt6.4□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 YLL056CYLL056C 897 nt6.4□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 DPH5YLR172C 903 nt6.4□□□□□ -1.38
SNF8Q12483 GPA1YHR005C 1419 nt6.4□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 STT3YGL022W 2157 nt6.4□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 TRR1YDR353W 960 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.39□□□□□ -1.39
SNF8Q12483 RRN10YBL025W 438 nt6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms