Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 ARP3YJR065C 1350 nt7.97□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 YJL144WYJL144W 315 nt7.96□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 GCN3YKR026C 918 nt7.96□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 CUE4YML101C 354 nt7.96□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 GET4YOR164C 939 nt7.96□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 NAF1YNL124W 1479 nt7.95□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 YDL177CYDL177C 513 nt7.95□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 DML1YMR211W 1428 nt7.95□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 CLN1YMR199W 1641 nt7.94□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 TOS6YNL300W 309 nt7.94□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 RSP5YER125W 2430 nt7.93□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 IRC11YOR013W 471 nt7.93□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 PAU21YOR394W 495 nt7.93□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 PAU22YPL282C 495 nt7.93□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 PTC7YHR076W 1032 nt7.92□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 SPG5YMR191W 1122 nt7.92□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 NTG2YOL043C 1143 nt7.92□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 SKY1YMR216C 2229 nt7.91□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 CIA1YDR267C 993 nt7.91□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 YDR415CYDR415C 1125 nt7.91□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 FPR2YDR519W 408 nt7.9□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 AIM33YML087C 939 nt7.9□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 YNR005CYNR005C 405 nt7.9□□□□□ -1.14
LSP1Q12230 TOS2YGR221C 1869 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 MLS1YNL117W 1665 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YMR034CYMR034C 1305 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 PDA1YER178W 1263 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 TRR2YHR106W 1029 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 VBA5YKR105C 1749 nt7.89□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 VTS1YOR359W 1572 nt7.88□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 PHO3YBR092C 1404 nt7.88□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 HIS1YER055C 894 nt7.88□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YIP4YGL198W 708 nt7.88□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 EMP65YER140W 1671 nt7.88□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 HSM3YBR272C 1443 nt7.87□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YPT1YFL038C 621 nt7.87□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YSC83YHR017W 1158 nt7.87□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 RIB1YBL033C 1038 nt7.87□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 HEM1YDR232W 1647 nt7.87□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 GTT3YEL017W 1014 nt7.86□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 SES1YDR023W 1389 nt7.85□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 UME1YPL139C 1383 nt7.85□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YKR032WYKR032W 315 nt7.85□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 KAE1YKR038C 1161 nt7.85□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 HTZ1YOL012C 405 nt7.85□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YPL067CYPL067C 597 nt7.85□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 SMX3YPR182W 261 nt7.85□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YHR020WYHR020W 2067 nt7.84□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 PPM2YOL141W 2088 nt7.84□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 YGL102CYGL102C 429 nt7.84□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 ATG36YJL185C 882 nt7.84□□□□□ -1.15
LSP1Q12230 CCC2YDR270W 3015 nt7.84□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 CIR2YOR356W 1896 nt7.83□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 ERG12YMR208W 1332 nt7.83□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 MRPS28YDR337W 861 nt7.83□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 ECM30YLR436C 3825 nt7.83□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 HED1YDR014W-A 489 nt7.82□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 YLL058WYLL058W 1728 nt7.82□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 ACO1YLR304C 2337 nt7.82□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 snR30snR30 606 nt7.82□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 EDE1YBL047C 4146 nt7.81□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 PRP2YNR011C 2631 nt7.81□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 GLN3YER040W 2193 nt7.81□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 STT3YGL022W 2157 nt7.81□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 YDR306CYDR306C 1437 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 CYS3YAL012W 1185 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 COX5AYNL052W 462 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 PRS4YBL068W 981 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 YPQ1YOL092W 927 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 MBF1YOR298C-A 456 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 SEC62YPL094C 825 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 YCL049CYCL049C 939 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 MIP1YOR330C 3765 nt7.8□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.79□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 PIH1YHR034C 1035 nt7.79□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 FBA1YKL060C 1080 nt7.79□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 ARG81YML099C 2643 nt7.79□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 ADE17YMR120C 1779 nt7.78□□□□□ -1.16
LSP1Q12230 HEM2YGL040C 1029 nt7.77□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 PRI1YIR008C 1230 nt7.77□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 YOR343CYOR343C 327 nt7.77□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 PMT3YOR321W 2262 nt7.77□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 ICP55YER078C 1536 nt7.77□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 APE4YHR113W 1473 nt7.76□□□□□ -1.17
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