Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPAL4Q0D2K0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPAL4Q0D2K0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPAL4Q0D2K0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms