Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 EFT1YOR133W 2529 nt5.85□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 HXK2YGL253W 1461 nt5.84□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 IRC5YFR038W 2562 nt5.84□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 YGR127WYGR127W 939 nt5.84□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 NFS1YCL017C 1494 nt5.83□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 SKI2YLR398C 3864 nt5.83□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 PXL1YKR090W 2121 nt5.83□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 RTC4YNL254C 1206 nt5.83□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 SMK1YPR054W 1167 nt5.83□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 Q0010Q0010 387 nt5.83□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 ALT2YDR111C 1524 nt5.83□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 DML1YMR211W 1428 nt5.82□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.82□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 CYB2YML054C 1776 nt5.82□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 MRPL28YDR462W 444 nt5.81□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 DMC1YER179W 1005 nt5.81□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 YNL200CYNL200C 741 nt5.81□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 CEM1YER061C 1329 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 CTA1YDR256C 1548 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 HXT15YDL245C 1704 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 HXT16YJR158W 1704 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 MSG5YNL053W 1470 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 YCR049CYCR049C 447 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 ERS1YCR075C 783 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 HPT1YDR399W 666 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 THI4YGR144W 981 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 CCP1YKR066C 1086 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 BUD20YLR074C 501 nt5.8□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 MLS1YNL117W 1665 nt5.79□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 TAH11YJR046W 1815 nt5.79□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 ATP23YNR020C 813 nt5.79□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 FCY22YER060W-A 1593 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 YIL055CYIL055C 1884 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 NTG1YAL015C 1200 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 GET4YOR164C 939 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 HBN1YCL026C-B 582 nt5.78□□□□□ -1.48
HRD1Q08109 YBR241CYBR241C 1467 nt5.77□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 NUP84YDL116W 2181 nt5.77□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 TUF1YOR187W 1314 nt5.77□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 snR82snR82 268 nt5.77□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 YAL045CYAL045C 309 nt5.77□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 CEF1YMR213W 1773 nt5.77□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 LAG2YOL025W 1983 nt5.76□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 RPL2BYIL018W 765 nt5.76□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 ACS1YAL054C 2142 nt5.76□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 PLB2YMR006C 2121 nt5.76□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 YBL070CYBL070C 321 nt5.76□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 YOL099CYOL099C 492 nt5.76□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 TRR2YHR106W 1029 nt5.75□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 YPL247CYPL247C 1572 nt5.75□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 HIS7YBR248C 1659 nt5.75□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 PIH1YHR034C 1035 nt5.74□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 PTH2YBL057C 627 nt5.74□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 YPL067CYPL067C 597 nt5.74□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 LDB19YOR322C 2457 nt5.73□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 KAE1YKR038C 1161 nt5.73□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 PRS4YBL068W 981 nt5.73□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 YPR130CYPR130C 408 nt5.73□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 COX16YJL003W 357 nt5.72□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 HOG1YLR113W 1308 nt5.72□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 PAC2YER007W 1557 nt5.72□□□□□ -1.49
HRD1Q08109 PTC7YHR076W 1032 nt5.71□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YNR005CYNR005C 405 nt5.71□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 CCT3YJL014W 1605 nt5.7□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 MPA43YNL249C 1629 nt5.7□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YML079WYML079W 606 nt5.7□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 HTZ1YOL012C 405 nt5.7□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 OPI11YPR044C 354 nt5.7□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 ATG22YCL038C 1587 nt5.7□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YMR034CYMR034C 1305 nt5.7□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 GSH1YJL101C 2037 nt5.69□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 CIA1YDR267C 993 nt5.69□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.69□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 CTF8YHR191C 402 nt5.69□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 NTG2YOL043C 1143 nt5.69□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 RAP1YNL216W 2484 nt5.69□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 REC107YJR021C 945 nt5.68□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YNR014WYNR014W 639 nt5.68□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YPQ1YOL092W 927 nt5.68□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 RBS1YDL189W 1374 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YEL020CYEL020C 1683 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YDL177CYDL177C 513 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 PPH22YDL188C 1134 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 EDC2YER035W 438 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 YIL077CYIL077C 963 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 GCN3YKR026C 918 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 VHT1YGR065C 1782 nt5.67□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 RGD2YFL047W 2145 nt5.66□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 HXT17YNR072W 1695 nt5.66□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 URH1YDR400W 1023 nt5.66□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 CST26YBR042C 1194 nt5.66□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 ERG10YPL028W 1197 nt5.66□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 KNS1YLL019C 2214 nt5.66□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 CSC1YLR241W 2349 nt5.65□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 NAF1YNL124W 1479 nt5.65□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 TRS31YDR472W 852 nt5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.2 ms