Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TFF3Q07654 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TFF3Q07654 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms