Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCDQ05655 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKCDQ05655 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms