Protein–RNA interactions for Protein: Q04839

GFD1, mRNA transport factor GFD1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GFD1Q04839 YIP4YGL198W 708 nt7.54□□□□□ -1.2
GFD1Q04839 PTC7YHR076W 1032 nt7.54□□□□□ -1.2
GFD1Q04839 YJL045WYJL045W 1905 nt7.54□□□□□ -1.2
GFD1Q04839 TRS31YDR472W 852 nt7.53□□□□□ -1.2
GFD1Q04839 RPL31BYLR406C 342 nt7.52□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 RPR1RPR1 369 nt7.52□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 SLA2YNL243W 2907 nt7.52□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 CCR4YAL021C 2514 nt7.52□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 LAT1YNL071W 1449 nt7.52□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 RGD2YFL047W 2145 nt7.51□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 URH1YDR400W 1023 nt7.51□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YNR014WYNR014W 639 nt7.51□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 RQC1YDR333C 2172 nt7.51□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YLL058WYLL058W 1728 nt7.5□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 AIM46YHR199C 933 nt7.5□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 CBR1YIL043C 855 nt7.5□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YOX1YML027W 1158 nt7.5□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YMR034CYMR034C 1305 nt7.5□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.49□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 COX16YJL003W 357 nt7.49□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YDL177CYDL177C 513 nt7.48□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YGL102CYGL102C 429 nt7.48□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 MRPS28YDR337W 861 nt7.47□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YSC83YHR017W 1158 nt7.47□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 SMX3YPR182W 261 nt7.47□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 YLL066CYLL066C 3618 nt7.47□□□□□ -1.21
GFD1Q04839 PPH22YDL188C 1134 nt7.46□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 PUS7YOR243C 2031 nt7.45□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 YOR389WYOR389W 1875 nt7.45□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 PRI1YIR008C 1230 nt7.45□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 ERG10YPL028W 1197 nt7.45□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 HXT13YEL069C 1695 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 YJL163CYJL163C 1668 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 ICP55YER078C 1536 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 YLL056CYLL056C 897 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 SML1YML058W 315 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 FIT2YOR382W 462 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 YPL041CYPL041C 624 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 OPI11YPR044C 354 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 MFG1YDL233W 1377 nt7.44□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 PEX31YGR004W 1389 nt7.43□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 MSC3YLR219W 2187 nt7.42□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 GCN3YKR026C 918 nt7.42□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 MRPL19YNL185C 477 nt7.42□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 ZIM17YNL310C 525 nt7.42□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 IRC11YOR013W 471 nt7.42□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 RPL5YPL131W 894 nt7.42□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 RRN10YBL025W 438 nt7.41□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 NUP49YGL172W 1419 nt7.41□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 FCY22YER060W-A 1593 nt7.41□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 YHR020WYHR020W 2067 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 TRR1YDR353W 960 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 NAS6YGR232W 687 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 DYS1YHR068W 1164 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 MEU1YLR017W 1014 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 YOL046CYOL046C 675 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 SEC62YPL094C 825 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 SMK1YPR054W 1167 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 YPR076WYPR076W 375 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 HOG1YLR113W 1308 nt7.4□□□□□ -1.22
GFD1Q04839 MIP1YOR330C 3765 nt7.4□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 SSC1YJR045C 1965 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 HED1YDR014W-A 489 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 LCP5YER127W 1074 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 OPI8YKR035C 642 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 TMA46YOR091W 1038 nt7.39□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 COG1YGL223C 1254 nt7.38□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 PPM2YOL141W 2088 nt7.38□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 CMK2YOL016C 1344 nt7.37□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 HIS1YER055C 894 nt7.37□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 AGX1YFL030W 1158 nt7.37□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 SWD1YAR003W 1281 nt7.37□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 YTH1YPR107C 627 nt7.37□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 ECM27YJR106W 2178 nt7.36□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 YJR107WYJR107W 987 nt7.36□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 STT3YGL022W 2157 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 YDR415CYDR415C 1125 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 ATG36YJL185C 882 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 CUE4YML101C 354 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 MCP1YOR228C 909 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 LGE1YPL055C 999 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 ADH5YBR145W 1056 nt7.35□□□□□ -1.23
GFD1Q04839 DOT1YDR440W 1749 nt7.35□□□□□ -1.23
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