Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 AIM17YHL021C 1398 nt6.62□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 BNA3YJL060W 1335 nt6.62□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 MRP1YDR347W 966 nt6.62□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 RIB1YBL033C 1038 nt6.62□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 LIP5YOR196C 1245 nt6.62□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 YKR018CYKR018C 2178 nt6.62□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 DDC1YPL194W 1839 nt6.62□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 EDC3YEL015W 1656 nt6.61□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.61□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 LCP5YER127W 1074 nt6.61□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 ATO2YNR002C 849 nt6.61□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 YKL147CYKL147C 618 nt6.6□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 ASR1YPR093C 867 nt6.6□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 RMD8YFR048W 1989 nt6.6□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 BDS1YOL164W 1941 nt6.6□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 AFG3YER017C 2286 nt6.6□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 YMR155WYMR155W 1644 nt6.59□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 TOD6YBL054W 1578 nt6.59□□□□□ -1.35
SPC19Q03954 CNM67YNL225C 1746 nt6.59□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 SKP1YDR328C 585 nt6.58□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.58□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 ADE1YAR015W 921 nt6.58□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.58□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 CDC13YDL220C 2775 nt6.58□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 SEC24YIL109C 2781 nt6.58□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 PGI1YBR196C 1665 nt6.58□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 CYS4YGR155W 1524 nt6.57□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 FCP1YMR277W 2199 nt6.57□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YCR049CYCR049C 447 nt6.57□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YGL260WYGL260W 231 nt6.57□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 AIM2YAL049C 741 nt6.57□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YML131WYML131W 1098 nt6.57□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 PET112YBL080C 1626 nt6.57□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 UTP9YHR196W 1728 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 FLC2YAL053W 2352 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YGL081WYGL081W 963 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YJR142WYJR142W 1029 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YKR073CYKR073C 321 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 DOM34YNL001W 1161 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 ADH5YBR145W 1056 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 DUG1YFR044C 1446 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 TOS1YBR162C 1368 nt6.56□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YCR041WYCR041W 333 nt6.55□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 CBT1YKL208W 816 nt6.55□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YNL108CYNL108C 813 nt6.55□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 CDC3YLR314C 1563 nt6.55□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 ACO1YLR304C 2337 nt6.55□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 NUP57YGR119C 1626 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 CDC34YDR054C 888 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 COX17YLL009C 210 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YBR027CYBR027C 333 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 RFS1YBR052C 633 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 FCY2YER056C 1602 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 RDR1YOR380W 1641 nt6.54□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 SNF4YGL115W 969 nt6.53□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 YJL213WYJL213W 996 nt6.53□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 PAM17YKR065C 594 nt6.53□□□□□ -1.36
SPC19Q03954 PET117YER058W 324 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 PIL1YGR086C 1020 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 CCW12YLR110C 402 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 RPL43AYPR043W 279 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 CIT2YCR005C 1383 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 HRB1YNL004W 1365 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 PET494YNR045W 1470 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 APM4YOL062C 1476 nt6.52□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 ECM7YLR443W 1347 nt6.51□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 SNF11YDR073W 510 nt6.51□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 MSI1YBR195C 1269 nt6.51□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 SDH8YBR269C 417 nt6.51□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 EMW1YNL313C 2715 nt6.51□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 ERG12YMR208W 1332 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 CDC7YDL017W 1524 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 TPK1YJL164C 1194 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 LOT6YLR011W 576 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 ECM2YBR065C 1095 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 SEC18YBR080C 2277 nt6.5□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 FRE5YOR384W 2085 nt6.49□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 YLR112WYLR112W 420 nt6.49□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 SEC17YBL050W 879 nt6.49□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 IRC11YOR013W 471 nt6.49□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 PDB1YBR221C 1101 nt6.49□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 ENB1YOL158C 1821 nt6.48□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 DPB2YPR175W 2070 nt6.48□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 PCS60YBR222C 1632 nt6.48□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 NMA2YGR010W 1188 nt6.48□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 YMR074CYMR074C 438 nt6.48□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 SRG1SRG1 551 nt6.47□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 ADK2YER170W 678 nt6.47□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 NCA3YJL116C 1014 nt6.47□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.47□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 FUS3YBL016W 1062 nt6.47□□□□□ -1.37
SPC19Q03954 PAU21YOR394W 495 nt6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.6 ms