Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC2Q02487 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSC2Q02487 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSC2Q02487 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms