Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAP84074 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAP84074 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAP84074 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAP84074 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAP84074 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAP84074 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAP84074 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAP84074 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAP84074 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPCAP84074 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPCAP84074 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPCAP84074 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAP84074 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAP84074 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAP84074 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAP84074 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAP84074 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAP84074 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAP84074 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAP84074 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAP84074 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAP84074 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAP84074 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAP84074 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAP84074 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAP84074 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAP84074 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAP84074 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAP84074 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAP84074 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAP84074 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAP84074 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAP84074 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAP84074 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAP84074 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPCAP84074 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPCAP84074 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPCAP84074 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPCAP84074 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPCAP84074 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPCAP84074 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPCAP84074 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPCAP84074 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPCAP84074 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPCAP84074 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPCAP84074 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPCAP84074 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPCAP84074 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPCAP84074 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPCAP84074 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPCAP84074 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPCAP84074 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPCAP84074 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPCAP84074 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPCAP84074 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPCAP84074 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPCAP84074 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPCAP84074 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPCAP84074 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPCAP84074 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPCAP84074 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPCAP84074 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPCAP84074 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPCAP84074 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPCAP84074 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPCAP84074 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HPCAP84074 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPCAP84074 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPCAP84074 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPCAP84074 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPCAP84074 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPCAP84074 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPCAP84074 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPCAP84074 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAP84074 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms