Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL7P80098 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL7P80098 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL7P80098 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL7P80098 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL7P80098 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL7P80098 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL7P80098 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL7P80098 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL7P80098 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL7P80098 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL7P80098 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL7P80098 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL7P80098 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL7P80098 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL7P80098 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL7P80098 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL7P80098 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL7P80098 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL7P80098 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL7P80098 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL7P80098 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL7P80098 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL7P80098 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL7P80098 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL7P80098 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL7P80098 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL7P80098 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL7P80098 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL7P80098 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL7P80098 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL7P80098 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL7P80098 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL7P80098 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL7P80098 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL7P80098 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL7P80098 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL7P80098 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL7P80098 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL7P80098 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL7P80098 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCL7P80098 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL7P80098 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL7P80098 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL7P80098 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL7P80098 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL7P80098 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL7P80098 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL7P80098 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL7P80098 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL7P80098 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL7P80098 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL7P80098 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL7P80098 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL7P80098 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL7P80098 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL7P80098 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL7P80098 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL7P80098 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL7P80098 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL7P80098 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL7P80098 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL7P80098 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL7P80098 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL7P80098 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL7P80098 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL7P80098 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCL7P80098 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL7P80098 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL7P80098 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL7P80098 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL7P80098 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL7P80098 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL7P80098 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCL7P80098 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCL7P80098 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCL7P80098 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms