Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC6P62333 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC6P62333 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PSMC6P62333 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms