Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP10-9P60411 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP10-9P60411 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP10-9P60411 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRTAP10-9P60411 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP10-9P60411 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRTAP10-9P60411 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms