Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS3P57727 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS3P57727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS3P57727 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS3P57727 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS3P57727 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms