Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBASH3AP57075 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBASH3AP57075 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBASH3AP57075 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBASH3AP57075 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms