Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA4P54764 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA4P54764 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA4P54764 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms