Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPAP53621 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPAP53621 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPAP53621 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPAP53621 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPAP53621 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPAP53621 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPAP53621 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPAP53621 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPAP53621 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPAP53621 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPAP53621 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPAP53621 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPAP53621 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPAP53621 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPAP53621 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPAP53621 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPAP53621 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPAP53621 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPAP53621 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPAP53621 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPAP53621 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPAP53621 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPAP53621 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPAP53621 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPAP53621 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPAP53621 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COPAP53621 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPAP53621 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPAP53621 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPAP53621 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPAP53621 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPAP53621 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPAP53621 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPAP53621 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPAP53621 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPAP53621 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPAP53621 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPAP53621 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPAP53621 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPAP53621 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPAP53621 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPAP53621 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPAP53621 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPAP53621 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPAP53621 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPAP53621 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPAP53621 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPAP53621 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPAP53621 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPAP53621 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPAP53621 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPAP53621 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPAP53621 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPAP53621 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPAP53621 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COPAP53621 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPAP53621 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPAP53621 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPAP53621 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPAP53621 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPAP53621 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPAP53621 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPAP53621 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPAP53621 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPAP53621 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPAP53621 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
COPAP53621 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPAP53621 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPAP53621 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPAP53621 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPAP53621 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPAP53621 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPAP53621 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPAP53621 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPAP53621 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPAP53621 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPAP53621 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPAP53621 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPAP53621 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPAP53621 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPAP53621 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPAP53621 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms