Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGDP52209 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGDP52209 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGDP52209 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGDP52209 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGDP52209 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGDP52209 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGDP52209 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGDP52209 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGDP52209 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGDP52209 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGDP52209 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGDP52209 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGDP52209 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGDP52209 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGDP52209 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGDP52209 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGDP52209 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGDP52209 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGDP52209 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGDP52209 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGDP52209 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGDP52209 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGDP52209 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGDP52209 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGDP52209 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGDP52209 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGDP52209 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGDP52209 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGDP52209 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGDP52209 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGDP52209 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGDP52209 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGDP52209 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGDP52209 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGDP52209 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGDP52209 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGDP52209 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGDP52209 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGDP52209 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGDP52209 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGDP52209 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGDP52209 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGDP52209 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGDP52209 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGDP52209 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGDP52209 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGDP52209 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGDP52209 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGDP52209 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGDP52209 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGDP52209 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGDP52209 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGDP52209 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGDP52209 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGDP52209 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGDP52209 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGDP52209 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGDP52209 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGDP52209 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGDP52209 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGDP52209 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGDP52209 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGDP52209 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGDP52209 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGDP52209 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGDP52209 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGDP52209 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGDP52209 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGDP52209 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGDP52209 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PGDP52209 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGDP52209 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGDP52209 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms