Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX5P50542 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX5P50542 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX5P50542 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX5P50542 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX5P50542 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX5P50542 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX5P50542 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX5P50542 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX5P50542 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX5P50542 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX5P50542 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX5P50542 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PEX5P50542 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PEX5P50542 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PEX5P50542 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PEX5P50542 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX5P50542 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX5P50542 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX5P50542 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX5P50542 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX5P50542 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX5P50542 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX5P50542 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX5P50542 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX5P50542 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX5P50542 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX5P50542 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX5P50542 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX5P50542 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX5P50542 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX5P50542 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX5P50542 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX5P50542 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX5P50542 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX5P50542 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX5P50542 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX5P50542 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX5P50542 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX5P50542 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX5P50542 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX5P50542 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX5P50542 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX5P50542 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX5P50542 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX5P50542 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX5P50542 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX5P50542 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms