Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK1P49759 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK1P49759 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK1P49759 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK1P49759 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK1P49759 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK1P49759 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK1P49759 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK1P49759 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK1P49759 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLK1P49759 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK1P49759 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK1P49759 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK1P49759 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK1P49759 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK1P49759 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK1P49759 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLK1P49759 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK1P49759 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK1P49759 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK1P49759 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLK1P49759 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK1P49759 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK1P49759 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK1P49759 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK1P49759 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLK1P49759 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK1P49759 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK1P49759 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLK1P49759 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK1P49759 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLK1P49759 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK1P49759 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK1P49759 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK1P49759 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK1P49759 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK1P49759 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLK1P49759 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK1P49759 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK1P49759 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK1P49759 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLK1P49759 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK1P49759 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK1P49759 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK1P49759 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK1P49759 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK1P49759 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK1P49759 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK1P49759 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK1P49759 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK1P49759 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK1P49759 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK1P49759 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK1P49759 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK1P49759 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK1P49759 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK1P49759 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK1P49759 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK1P49759 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK1P49759 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK1P49759 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK1P49759 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK1P49759 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK1P49759 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK1P49759 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK1P49759 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK1P49759 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK1P49759 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK1P49759 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK1P49759 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms