Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM25P49756 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM25P49756 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM25P49756 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM25P49756 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM25P49756 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RBM25P49756 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM25P49756 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RBM25P49756 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM25P49756 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM25P49756 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM25P49756 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RBM25P49756 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RBM25P49756 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM25P49756 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RBM25P49756 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM25P49756 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM25P49756 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RBM25P49756 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RBM25P49756 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RBM25P49756 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM25P49756 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM25P49756 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM25P49756 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM25P49756 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM25P49756 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RBM25P49756 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM25P49756 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM25P49756 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RBM25P49756 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM25P49756 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM25P49756 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM25P49756 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RBM25P49756 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM25P49756 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM25P49756 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM25P49756 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RBM25P49756 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM25P49756 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM25P49756 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM25P49756 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM25P49756 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM25P49756 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM25P49756 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM25P49756 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM25P49756 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RBM25P49756 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RBM25P49756 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM25P49756 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM25P49756 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM25P49756 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM25P49756 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM25P49756 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM25P49756 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM25P49756 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM25P49756 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM25P49756 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM25P49756 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM25P49756 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM25P49756 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM25P49756 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM25P49756 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM25P49756 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM25P49756 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM25P49756 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM25P49756 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM25P49756 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM25P49756 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM25P49756 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM25P49756 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM25P49756 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM25P49756 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM25P49756 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM25P49756 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM25P49756 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM25P49756 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM25P49756 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM25P49756 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM25P49756 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM25P49756 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM25P49756 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM25P49756 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM25P49756 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM25P49756 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM25P49756 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM25P49756 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM25P49756 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM25P49756 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM25P49756 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM25P49756 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM25P49756 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM25P49756 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms