Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB2P49721 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSMB2P49721 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSMB2P49721 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms