Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRGP48443 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRGP48443 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRGP48443 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRGP48443 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRGP48443 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRGP48443 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRGP48443 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRGP48443 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRGP48443 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RXRGP48443 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRGP48443 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRGP48443 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RXRGP48443 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRGP48443 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRGP48443 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRGP48443 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRGP48443 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRGP48443 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RXRGP48443 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRGP48443 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRGP48443 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRGP48443 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRGP48443 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRGP48443 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RXRGP48443 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RXRGP48443 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRGP48443 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRGP48443 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RXRGP48443 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRGP48443 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRGP48443 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRGP48443 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRGP48443 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRGP48443 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRGP48443 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RXRGP48443 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRGP48443 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRGP48443 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RXRGP48443 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRGP48443 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRGP48443 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRGP48443 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRGP48443 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRGP48443 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRGP48443 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRGP48443 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRGP48443 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRGP48443 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRGP48443 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRGP48443 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRGP48443 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRGP48443 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRGP48443 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRGP48443 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRGP48443 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRGP48443 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRGP48443 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRGP48443 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRGP48443 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRGP48443 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRGP48443 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRGP48443 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRGP48443 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRGP48443 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRGP48443 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRGP48443 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRGP48443 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRGP48443 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRGP48443 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRGP48443 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRGP48443 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRGP48443 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRGP48443 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRGP48443 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRGP48443 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRGP48443 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRGP48443 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRGP48443 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRGP48443 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRGP48443 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRGP48443 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRGP48443 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRGP48443 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRGP48443 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms