Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACADSBP45954 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACADSBP45954 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACADSBP45954 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACADSBP45954 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 681.7 ms