Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA4P43681 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA4P43681 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA4P43681 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA4P43681 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms