Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPD2P43304 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPD2P43304 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPD2P43304 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPD2P43304 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPD2P43304 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPD2P43304 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPD2P43304 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPD2P43304 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPD2P43304 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPD2P43304 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPD2P43304 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPD2P43304 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPD2P43304 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPD2P43304 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPD2P43304 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPD2P43304 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPD2P43304 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPD2P43304 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPD2P43304 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPD2P43304 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPD2P43304 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPD2P43304 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPD2P43304 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPD2P43304 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPD2P43304 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPD2P43304 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPD2P43304 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPD2P43304 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPD2P43304 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPD2P43304 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPD2P43304 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPD2P43304 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPD2P43304 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPD2P43304 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPD2P43304 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPD2P43304 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPD2P43304 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPD2P43304 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPD2P43304 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPD2P43304 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPD2P43304 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPD2P43304 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPD2P43304 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPD2P43304 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPD2P43304 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GPD2P43304 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPD2P43304 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPD2P43304 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPD2P43304 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPD2P43304 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPD2P43304 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPD2P43304 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPD2P43304 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPD2P43304 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPD2P43304 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPD2P43304 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPD2P43304 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPD2P43304 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPD2P43304 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPD2P43304 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPD2P43304 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPD2P43304 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPD2P43304 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPD2P43304 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPD2P43304 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPD2P43304 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPD2P43304 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPD2P43304 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPD2P43304 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPD2P43304 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
GPD2P43304 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPD2P43304 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPD2P43304 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPD2P43304 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPD2P43304 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPD2P43304 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPD2P43304 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPD2P43304 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPD2P43304 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPD2P43304 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPD2P43304 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPD2P43304 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPD2P43304 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPD2P43304 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GPD2P43304 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPD2P43304 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPD2P43304 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPD2P43304 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPD2P43304 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPD2P43304 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GPD2P43304 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPD2P43304 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPD2P43304 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPD2P43304 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPD2P43304 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPD2P43304 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPD2P43304 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPD2P43304 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPD2P43304 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms