Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YAL045CYAL045C 309 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 SPG5YMR191W 1122 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 MDH2YOL126C 1134 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 YBR027CYBR027C 333 nt8.75□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 SPT3YDR392W 1014 nt8.74□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 MSP1YGR028W 1089 nt8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 PRI1YIR008C 1230 nt8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 SKG1YKR100C 1068 nt8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 MHT1YLL062C 975 nt8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 YAR064WYAR064W 300 nt8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 CTA1YDR256C 1548 nt8.73□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 ERG8YMR220W 1356 nt8.72□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 CUP2YGL166W 678 nt8.72□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 RNH1YMR234W 1047 nt8.72□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 SNN1YNL086W 309 nt8.72□□□□□ -1.01
YRF1-2P40105 YDL172CYDL172C 480 nt8.71□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 YDL218WYDL218W 954 nt8.7□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 KSH1YNL024C-A 219 nt8.7□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 SYF2YGR129W 648 nt8.69□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 SEC62YPL094C 825 nt8.69□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 DSF1YEL070W 1509 nt8.69□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 YNR073CYNR073C 1509 nt8.69□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 YPR196WYPR196W 1413 nt8.68□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 UIP5YKR044W 1332 nt8.68□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 GNA1YFL017C 480 nt8.68□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 RPL31BYLR406C 342 nt8.68□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 SCS7YMR272C 1155 nt8.68□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 CDC23YHR166C 1881 nt8.68□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 MET2YNL277W 1461 nt8.67□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 YKL077WYKL077W 1179 nt8.67□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 HIS1YER055C 894 nt8.66□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 MRPL23YOR150W 492 nt8.66□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 MTF2YDL044C 1323 nt8.66□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 YRB2YIL063C 984 nt8.65□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 ADE2YOR128C 1716 nt8.65□□□□□ -1.02
YRF1-2P40105 UFD1YGR048W 1086 nt8.64□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt8.64□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 YNL200CYNL200C 741 nt8.64□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 YOR041CYOR041C 432 nt8.64□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 VBA5YKR105C 1749 nt8.64□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 NUP57YGR119C 1626 nt8.64□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 EXG2YDR261C 1689 nt8.63□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 HVG1YER039C 750 nt8.63□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 YNL017CYNL017C 339 nt8.62□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 SGF29YCL010C 780 nt8.62□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 DLD1YDL174C 1764 nt8.62□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 VPS24YKL041W 675 nt8.62□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 YLR126CYLR126C 756 nt8.62□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt8.62□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 IRC5YFR038W 2562 nt8.62□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 RSC30YHR056C 2652 nt8.61□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 ECM19YLR390W 339 nt8.61□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 DOT1YDR440W 1749 nt8.6□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 DFM1YDR411C 1026 nt8.6□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 RPL10YLR075W 666 nt8.6□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 ENV7YPL236C 1095 nt8.6□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 MSG5YNL053W 1470 nt8.59□□□□□ -1.03
YRF1-2P40105 FCY2YER056C 1602 nt8.58□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 MSO1YNR049C 633 nt8.58□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 PRY3YJL078C 2646 nt8.58□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 YHK8YHR048W 1545 nt8.57□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 RPN11YFR004W 921 nt8.57□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 ZRT2YLR130C 1269 nt8.57□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 CBR1YIL043C 855 nt8.56□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 SHP1YBL058W 1272 nt8.56□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 TIM22YDL217C 624 nt8.56□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 ERG1YGR175C 1491 nt8.55□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 PHO85YPL031C 918 nt8.55□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 SIT4YDL047W 936 nt8.54□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 MPC2YHR162W 390 nt8.54□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 YPR127WYPR127W 1038 nt8.54□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 AMN1YBR158W 1650 nt8.54□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 YMR034CYMR034C 1305 nt8.53□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.53□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.53□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 GON7YJL184W 372 nt8.53□□□□□ -1.04
YRF1-2P40105 MLS1YNL117W 1665 nt8.52□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 SWD1YAR003W 1281 nt8.52□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 YPL264CYPL264C 1062 nt8.52□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 YSC83YHR017W 1158 nt8.51□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 MRPS12YNR036C 462 nt8.5□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 MAL31YBR298C 1845 nt8.5□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 CHA1YCL064C 1083 nt8.49□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 NHA1YLR138W 2958 nt8.49□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 GCV3YAL044C 513 nt8.49□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 COQ1YBR003W 1422 nt8.49□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 YKR018CYKR018C 2178 nt8.48□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 SPE4YLR146C 903 nt8.47□□□□□ -1.05
YRF1-2P40105 DID2YKR035W-A 615 nt8.46□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 LPD1YFL018C 1500 nt8.45□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 ATP10YLR393W 840 nt8.45□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 HEM2YGL040C 1029 nt8.44□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 MTC2YKL098W 1074 nt8.44□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 PRC1YMR297W 1599 nt8.44□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 YDR015CYDR015C 240 nt8.43□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 URH1YDR400W 1023 nt8.43□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 PSR2YLR019W 1194 nt8.43□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 HXT9YJL219W 1704 nt8.43□□□□□ -1.06
YRF1-2P40105 CDC19YAL038W 1503 nt8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.6 ms