Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ZEB1P37275 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ZEB1P37275 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
ZEB1P37275 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZEB1P37275 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZEB1P37275 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms